在流程優化過程中，往往會挑選一些關鍵流程開展流程優化工作。因為是關鍵流程，一旦優化，往往具有直接的業務收益，同時又能夠讓組織內部相當多的人員所了解。而這類流程，通常涉及多個部門，需要協調一致才能有效改進與提高，一般做法是成立一個跨職能的團隊（Cross-functional Team），針對某一類業務或者流程開展優化工作。另外一個重要原因是，在流程優化的過程中，特別強調從不同的維度來觀察同一個流程。由于不同部門、不同的工作背景等，針對同一個流程，在具體優化的時候就會有不同的觀點產生，這些觀點之間又相互激蕩，產生新的想法和思路。通過這種腦力激蕩的工作，同時利用流程優化的各種方法，就可以達到流程優化的目的，甚至產生戲劇性的改善。跨部門流程優化需要高效運作的團隊
但是跨職能團隊不會自動成功，如何才能保證跨職能團隊的高效運作呢？組建跨職能團隊時，即成立了一個臨時的Project Team。首先一個問題就是如何選擇團隊的領導人和團隊成員。一般而言，在開展流程優化工作的時候，我們可以確定流程的所有者（Owner）。流程的所有者就是流程優化團隊的領導。只有在有一個部門為優化主體的情況下，流程優化的工作才能有效展開。如在研發相關的流程中，研發流程的所有者就是負責研發的總經理等。由于研發相關的流程還涉及工程、生產、銷售、市場、采購、財務等部門，因此也需要他們的參與才能夠有不同的視角和觀點，有力推動流程優化工作。
