高風險性是高新技術企業的本質特征，也是決定其發展的關鍵因素。高新技術企業的風險包括兩個層面：一是損失的可能性；二是企業發展終止的可能性。這些風險中，最突出的是技術風險和市場風險。技術風險是指在新產品研制和開發過程中，由于技術失敗而引致的損失，技術風險存在于高新技術企業發展的各個階段。
市場風險是指技術創新帶來的新產品能否被市場接受，能否取得足夠的市場份額。高新技術企業的市場風險主要表現為：產品市場容量不確定，新產品的需求規模預測通常不可靠；即使有需求，企業市場開拓和競爭的結果也不確定，成功的市場開發取決于正確的策略、足夠的投入以及全體 營銷 人員的創造性工作等一系列因素。
高投入是高新技術企業的又一特征。美國IBM公司在1980—1984年間的電子計算機開發費用和基建投資為280億美元，相當于40年代美國研究原子彈的曼哈頓計劃全部費用的14倍。在高新技術企業發展的各個階段，除R&D投資外，企業開辦費用、 市場營銷 、人員學習 等都需要大量資金投入。企業具有一定規模后，往往需要進一步投入資金，這一時期的資金需求量一般在數百萬到千萬美元之間。
高新技術企業進行融資決策時，既要考慮融資成本、代理成本等因素，更要結合自身所處的發展階段，選擇金融工具。在研究開發、創業和早期成長階段，企業收入不及支出，一直處于虧損狀態，但由于開發產品、拓展市場、學習 人員的需要，資本需求可能高達600萬美元。企業只能尋找外部資金來源。
在加速成長期，企業已達到收支平衡點，開始有所積累。但累計利潤尚未彌補以前年度的凈損失。而且企業發展也到了極為關鍵的時刻。企業面臨的技術風險結構變化，新產品開發風險下降，但市場風險和產業化風險卻大大提高。這一階段，資金需求也急速增長，可能高達1500萬美元，如果情況復雜，可能需要的資金更多。即使內部留存收益增長較快，也不能滿足發展的需要。
直接融資主體追求較高的投資收益，也愿意承擔較高的風險，是 金融市場 上的“風險愛好”者，間接融資主體則傾向于承擔較低的風險，只獲取穩定的收益。直接融資和間接融資這種對風險的偏好性決定了高新技術企業應以直接融資為主。
在企業發展的早期階段，風險因素多，收入不確定性大，與商業銀行的貸款原則有很大出入。商業銀行是典型的“風險厭惡”者，其青睞的對象是發展成熟且收入穩定，因而風險較小的企業。同樣的道理，高新技術企業也無法發行債券集資。出售股權進行直接融資是高新技術企業的唯一選擇。
直接融資與高新技術企業的風險變化相匹配，高新技術企業也為直接融資主體帶來了高收益。美國生物工程產業具有一定的代表性。1989年，美國生物工程產業基本上處于早期發展階段。這一年，10家主要生物技術公司 銷售 收入的總和還不到10億美元，合計的虧損則超過3000萬美元。以生物工程技術公司為例，在其資本來源中，只有5%來自債務融資，其余均來自各種直接融資。
西方傳統的成熟企業，融資策略上偏好內部融資和債權融資。高新技術企業從研究開發階段一直到成長為成熟企業，期間要面臨技術風險、市場風險、 財務風險 、人才風險、組織風險、外部環境風險，其中技術風險和市場風險在高新技術企業表現得更為突出。
但另一方面，高新技術企業表現出了良好的成長性。因此，高新技術企業高風險、高投入、高成長的特點，使其更適宜于進行直接融資，包括早期的 風險投資 和后期的公開發行 上市 。