面對電子商務環境，企業組織的實踐和理論均表明，傳統的企業組織結構正在呈現出扁平化的變化趨勢。有些專家學者針對財務組織提出了一系列概念，為財務組織結構的轉變提供了新的視角范圍。
2.整合財務處理流程
20世紀90年代，美國相關管理學家針對信息技術對管理的影響提出了“企業流程再造”思想，并在歐美等國企業掀起了“以流程再造”為核心的企業管理革命浪潮。企業充分利用信息技術的發展以及管理方式的組合，對組織架構和流程進行重新組合以及合并循環的環節。盡可能減少無效或不增值的活動，從整體流程全局最優的目標，設計和優化流程中的各項活動。
3.改進財務處理控制方法
長期以來，很多財務處理控制方法在財務管理中得到應用，如授權批準、財產保全及復式記賬等。但是，還有許多先進的方法，如全面預算、標準成本控制及無形資產計量評價等方法.在我國應用程度非常低。究其原因，除了經濟環境、思想觀念、財務人員素質外，更主要的原因是沒有把這些方法與信息技術結合。
4.創新財務制度
財務組織、財務流程、財務處理方法、財務信息系統的創新都受到財務制度的制約.尤其是宏觀財務制度。隨著社會經濟的增長和技術的快速發展，宏觀的財務制度或對創新企業財務管理造成一定的約束。探索電子商務環境下，企業會計制度、會計準則、財務管理制度威為理論研究的重要任務。
5.開發合適的財務軟件
目前，國內財務軟件大多數都沒有從根本上改變對傳統業務的模擬，只是對傳統會計處理改進基礎上。增加了對其他業務的模擬。以往的自動化流程思路仍然存在一定的原因，注意表現在兩方面：一方面是宏觀財務制度的限制因素。另一方面是軟件開發商在商品化市場環境中的限制因素。財務軟件模塊越來越多，價格越來越高，使用難度越來越大，不同軟件的模塊難以兼容，很多企業陷于兩難的困境，事項會計、事項法會計信息系統為電子商務環境下財務信息系統的設計展現了全新的視角。
